Álvarez K1, Villarroel C1, Orellana P1, Triviño JC2, Wielandt AM1, Kawachi H3, Kobayashi M3, Kronberg U1, Carvallo P4, López-Köstner F1. 1Laboratorio de Oncología y Genética Molecular, Unidad de Coloproctología, Clínica Las Condes, Santiago, Chile. 2Sistemas Genómicos S.L., Valencia, España. 3Latin America Colaborative Research Center, Tokyo Medical and Dental University, Clínica Las Condes, Santiago, Chile. 4Departamento de Biología Celular y Molecular, Facultad de Ciencias Biológicas, Pontificia Universidad Católica de Chile, Santiago, Chile
Introducción: El cáncer colorrectal es la cuarta causa de muerte por cáncer en Chile, y un aumento mayor al 100% ha sido observado. Objetivo: Caracterizar el perfil de mutaciones somáticas de genes de la vía de señalización del receptor de EGF en tumores colorrectales de pacientes chilenos y su correlación con características clínico-patológicas. Métodos: Se analizaron 56 tumores frescos-congelados desde pacientes con cáncer colorrectal esporádico, 33 hombres y 23 mujeres. Análisis molecular incluyó “next generation sequencing” y un panel de siete genes: EGFR-KRAS-BRAF-MAP2K1-PIK3CA-PIK3R1-PTEN, para obtener un alto rendimiento. Correlaciones fueron evaluadas con el test exacto de Fisher. Resultados: Al menos un gen mutado fue observado en 38/56 (68%) tumores. Los genes más frecuentemente mutados fueron KRAS (45%), PIK3CA (21%), BRAF (14%) y PTEN (5%). Once tumores presentaron mutaciones en ambas ramas del receptor EGF: KRAS/BRAF y PIK3CA/PTEN. Análisis de inestabilidad microsatelital demostró que 11/56 (20%) tumores presentan inestabilidad de alto grado, seis de ellos originada por la metilación del promotor de MLH1. Mutaciones en KRAS fueron características en hombres (p = 0,029), cáncer rectal (p = 0,014), linfonodos positivos (p = 0,01) y estadio IV (p = 0,014); mientras mutaciones en BRAF fueron más frecuentes en mujeres (p = 0,006), cáncer de colon derecho (p = 0,0068), carcinomas mucinosos (p = 0,058) y alta inestabilidad microsatelital (p < 0,0001). Mutaciones en KRAS y BRAF fueron mutuamente excluyentes (p=0.0063); mutaciones en BRAF y PIK3CA tienden a ocurrir conjuntamente (p = 0,05). Finalmente, tres subgrupos moleculares de tumores fueron identificados: i) con mutaciones KRAS/BRAF (n = 22); ii) con mutaciones PIK3CA/PTEN (n = 5) y iii) con mutaciones en ambos KRAS/BRAF y PIK3CA/PTEN (n = 11). Conclusiones: La aplicación de una tecnología de alto rendimiento y un panel de multigenes permitió detectar mutaciones en el 68% de los tumores. Este estudio sugiere tres subgrupos moleculares de cáncer colorrectal que pueden progresar y responder a terapia de forma diferente. Financiado por FONDECYT #1111020.