PDF | https://doi.org/10.46613/congastro2023-186
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Uribe J1, Pino K1, Vera J1, Nuñez R1, López-Lastra M1, Fuster F2, Soza A1
1Pontificia Universidad Católica de Chile, Santiago, Chile
2Hospital Gustavo Fricke, Viña del Mar, Chile
Introducción: La infección por virus hepatitis B (VHB) presenta distintos genotipos, variantes virales y mutantes de escape (ME) que pueden influir la progresión de la enfermedad y respuesta a la vacunación. La prevalencia y características moleculares del VHB en población migrante haitiana en Chile son poco conocidas.
Objetivo: Describir los genotipos específicos del VHB que infectan población migrante haitiana en Chile y compararla con aislados en población chilena usando secuenciación de genoma completo por next-generation sequencing (NGS).
Métodos: 32 sujetos fueron incluidos en este estudio. 8 fueron migrantes haitianos y 24 chilenos. El ADN del VHB fue secuenciado utilizando NGS, con un Phred score promedio 32 (precisión 99.9%). Los archivos FASTQ sin procesar se clasificaron taxonómicamente utilizando Kraken2, se alinearon con BWA y se detectó variantes con LoFreq. Las variantes se registraron usando SnpEff, y los ME se identificaron usando geno2pheno. La genotipificación, sub-genotipificación y serotipificación fueron realizadas usando geno2pheno, HBVseq, y HBV Serotyper.
Resultados: Los pacientes chilenos fueron principalmente infectados por VHB genotipo F1 (23) y D4 (1). En contraste, la población haitiana migrante presentó infección por genotipo A1 (1), E (1) y F1 (3). Numerosas mutaciones fueron identificadas en preS1, preS2, S, P, X, preC y genes C, siendo algunas de ellas previamente asociadas a ME. En la determinante ’a’ (codones 121-147 del gen S), la porción inmunodominante del HBsAg, 50 mutaciones fueron identificadas, presentes tanto en población haitiana como chilena (75%).
Conclusiones: Este estudio revela distintos genotipos de VHB y potenciales ME entre la población migrante haitiana y los pacientes chilenos, importante para entender las dinámicas moleculares de infección por VHB en distintas poblaciones dentro del país. Estos hallazgos sirven como insumo para políticas de salud pública y optimizar las estrategias de vacunación de los grupos marginados, como lo son los haitianos inmigrantes en Chile.
