PDF | DOI: 10.46613/congastro2024-033
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Tamara Pérez Jeldres1, Danilo Alvares2, Maria Leonor Bustamante3, Gabriel Ascui4, Manuel Álvarez Lobos5, Ricardo Estela6, Roberto Segovia5, Roberto Candia5, Carolina Pavez5, Cristian Hernández-Rocha5, Nataly Aguilar5, Lorena Azocar5, Mauricio González6, Elizabeth Arriagada6, Veronica Silva6, Andrés De la Vega6, Colomba Cofre5, Juan-Francisco Miquel5, Alex Di Genova7
1Pontificia Universidad Católica/Instituto Chileno Japones, 2University of Cambridge, 3Universidad de Chile, 4La Jolla Insitute for Inmunology, 5Pontificia Universidad Católica, 6Instituto Chileno Japones, 7Universidad de O’Higgins.
Antecedentes. La enfermedad inflamatoria intestinal (EII) está en aumento en América del Sur, pero esta población sigue estando subrepresentada en los estudios genéticos de la EII. Además, la estructura genética varía entre los países Sudamericanos, lo que destaca la necesidad de estudios que evalúen la estructura genética y su asociación con los fenotipos de la EII. Objetivo. Realizamos un estudio para examinar la correlación entre la ascendencia amerindia y los fenotipos de la EII dentro de una cohorte sudamericana. Además, investigamos la asociación entre las variantes de riesgo de la EII previamente identificadas y los fenotipos de la EII. Métodos. Realizamos un análisis de ascendencia global utilizando ADMIXTURE. Empleamos un panel de referencia de poblaciones obtenido del Proyecto 1000 Genomas y HapMap para nuestros análisis. Evaluamos la estructura ancestral en 291 pacientes con EII y 51 controles, con el objetivo de examinar la asociación entre la ascendencia amerindia (AMR) y las variables de la EII. Además, evaluamos el impacto de las variantes de riesgo de la EII previamente identificadas en los resultados clínicos de la EII. Para comparar los diferentes grupos, utilizamos pruebas estadísticas (Chi-cuadrado para frecuencia y prueba U de Mann-Whitney para comparaciones de medianas). Se desarrollaron modelos de predicción para analizar los datos de manera más detallada. Resultados. La distribución mediana de la ascendencia fue 58% europea, 39% amerindia y 2% africana. No hubo diferencias significativas en el riesgo de la EII basado en la proporción de ascendencia entre los casos y los controles. Los pacientes con colitis ulcerosa (CU) diagnosticados antes de los 40 años tenían una proporción mediana de ascendencia amerindia más alta en comparación con aquellos diagnosticados más tarde (39.9% versus 37.4%, valor de P = 0.01). Por el contrario, los pacientes con CU con remisión clínica y endoscópica prolongada tenían una proporción mediana de ascendencia amerindia más baja (35% versus 39%, valor de P = 0.02). En el grupo de enfermedad de Crohn (EC), la proporción mediana de ascendencia amerindia fue más baja en el grupo con enfermedad perianal en comparación con el grupo sin esta condición (33.5% versus 39.5%, valor de P = 0.03). Además, solo el 6% de los pacientes sometidos a cirugía de resección tenían una proporción más alta de ascendencia amerindia. La presencia de al menos un resultado asociado con un curso grave de la enfermedad fue la característica más importante para predecir la remisión prolongada, con una importancia del 85% en el árbol de decisión y del 75% en el modelo de Random Forest. Conclusión. Nuestro estudio sugiere un impacto de la ascendencia amerindia en los fenotipos de la EII. Además, se observaron variaciones en la influencia de la ascendencia amerindia en los pacientes con CU y EC. Se necesita una investigación adicional para desentrañar los mecanismossubyacentes que impulsan estas asociaciones.
