Gastroenterol. latinoam 2016; Vol 27; Supl. 2
Bustos B1, Pérez-Palma E1, Buch S2, Azócar L3, Riveras E3, Moraga C4, Toilat M5, Hampe J2, Nürnberg P5, Gutiérrez RA4,6, De Ferrari GV1,6, Miquel JF3,6. 1Centro de Investigaciones Biomédicas, Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Andrés Bello. 2Medical Department, University Hospital Dresden, TU Dresden. 3Departamento de Gastroenterología, Facultad de Medicina, Pontificia Universidad Católica de Chile. 4Departamento Genética Molecular y Microbiología, Facultad de Ciencias Biológicas, Pontificia Universidad Católica de Chile. 5Cologne Center for Genomics, University of Cologne. 6FONDAP Center for Genome Regulation (CGR).
Introducción: La litiasis biliar (LB) es una enfermedad gastrointestinal compleja con alta prevalencia en Chile donde pocos estudios genéticos se han realizado para determinar su susceptibilidad. Objetivo: Realizar un estudio de asociación de genoma completo de dos fases (descubrimiento y replicación) en una población Chilena caso-control para GSD. Métodos: Los individuos fueron reclutados desde centros médicos comunitarios en la ciudad de Santiago y fueron diagnosticado (casos o controles) por ecografía abdominal. La genotipación a genoma completo se realizó con el chip Axiom LAT 1 World de Affymetrix. La replicación y los análisis de expresión génica se realizaron mediante RT-qPCR con sondas TaqMan y partidores de ADN específicos, respectivamente. Resultados: En la fase de descubrimiento que contempló 1.095 individuos (529 casos, 566 controles), se seleccionó 10 loci candidatos que superaron el límite sugestivo de asociación a genoma completo (< 1×10-5). La replicación se realizó en una cohorte de 1.868 individuos (707 casos y 1.161 controles), donde se replicó con éxito 2 señales: la ya conocida señal en el gen ABCG8 (rs11887534; p = 3,24×10-8, OR = 1,74) y una nueva señal en el cromosoma 14 (rs12882491; p = 1,11×10-7, OR = 1,40) en el gen TRAF3. El análisis de expresión diferencial en casos vs controles mostró una disminución significativa de los niveles de TRAF3 en tejido de vesícula biliar (Tasa de cambio = 0,51, p = 0,015 y duodenal (tasa de cambio = 0,50, p = 0,001). Conclusión: TRAF3 regula vías que conducen a la activación de la vía NF-kappa-B y sus bajos niveles de expresión podrían estar relacionado con una mayor presencia de inflamación crónica y aguda de la vesícula biliar, la cual está implicada tanto en la patogénesis como en el desarrollo de la enfermedad. Financiamiento: FONDECYT # 1130303-JFM, # 1140353-GVD, FONDAP # 1509000.